A 15 anni si è trasferito in Florida per frequentare la Nick Bollettieri Tennis Academy. Nel 2008 ha raggiunto le semifinali di Wimbledon e dello Us Open a livello Juniores.[1] I suoi primi punti ATP gli vengono attribuiti a maggio, dove arriva al terzo turno di un futures americano. A Knoxville ha battuto l'allora numero 83 al mondo Kendrick.
Nel 2009 ha raggiunto per tre volte la finale di un evento dell'ATP Challenger Series. Il 7 maggio 2010 raggiunge la semifinale del Serbia Open grazie al ritiro del numero 2 del Ranking ATPNovak Đoković, dopo la vittoria del primo set da parte del giovane serbo. Questo risultato gli vale il raggiungimento del suo best ranking, alla posizione numero 209. In seguito migliora la sua classifica con la finale del challenger di Kosice, che gli vale il raggiungimento della 170ª posizione.
Il 6 novembre 2017, in seguito alla finale al Master 1000 di Parigi migliora ancora il suo posto nella classifica mondiale raggiungendo la 33ma posizione. Il 23 aprile 2018 conquista il 26º posto ATP, sua attuale migliore posizione. Inizia il 2020 sul cemento di Doha. Nei sedicesimi di finale batte l'inglese Kyle Edmund in 3 set, ma viene poi sconfitto agli ottavi dallo spagnolo Fernando Verdasco, sempre in 3 set.
^ itftennis.com, Filip Krajinović - Junior Profile, su itftennis.com. URL consultato il 24 novembre 2012 (archiviato dall'url originale il 4 novembre 2013).
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(EN) Filip Krajinović, su atpworldtour.com, ATP Tour Inc.
1ª N. Đoković (1) · 2ª L. Đere (33) · 3ª D. Lajović (52) · 4ª M. Kecmanović (54) · 5ª H. Međedović (113) 6ª F. Krajinović (312) · 7ª M. Zekić (420) · 8ª S. Popović (615) · 9ª D. Obradović (673) · 10ª V. Jović (776) ·